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| 1996年 6月17日 | | 日本国際フォーラム内に「予防外交国際研究グループ」発足 |
| 1999年 3月30日 | | 伊藤憲一日本国際フォーラム理事長、小渕恵三首相を往訪し、設立支援要請 |
| 7月19日 | | 「日本予防外交センター」設立発起人会開催、明石康会長、伊藤憲一運営委員長選任 |
| 8月27日 | | 『予防外交入門』『日本予防外交センターのしおり』刊行 |
| 9月 7日 | | 「予防外交セミナー｣（現在「紛争予防市民大学院『セミナーコース』」）開講 |
| 11月 9日 | | 「予防外交海外派遣隊｣（現在「紛争予防市民大学院『海外研修コース』」）出発 |
| 12日 | | 「国際政経懇話会」開始（現在に至る） |
| 2000年 1月 1日 | | 季刊『会報』創刊（現在に至る） |
| 4-14日 | | 伊藤運営委員長、阿曽村邦昭参与がスリランカ、イスラエルを訪ね、現地NGOと提携覚書調印 |
| 2月9-10日 | | 「日中予防外交研究会」第１回合同会議（東京）開催 |
| 21日 | | 第1回運営委員会にて阿曽村邦昭所長選任 |
| 4月 1日 | | ホームページおよび紛争予防対話掲示板DWCW開設 |
| 5月22日 | | 在中東代表事務所開設 |
| 8月14日 | | 在南西アジア代表事務所（現在、在スリランカ代表事務所）開設 |
| 23日 | | 「ジャパン・プラットフォーム」のNGOユニット理事就任 |
| 11月13日 | | 第2回理事会にて、「センター基金」(現在「センター特別基金」)設置 |
| 12月18日 | | 『Directory of Organizations for Conflict Prevention in Asia and the Pacific 』刊行 |
| 29日 | | 『現代予防外交論』刊行 |
| 2001年2月5-28日 | | インド西部大地震救援のため池上善晴在南西アジア代表事務所員を現地に急派 |
| 8日 | | 『DWCW Newsletter』創刊 |
| 19-22日 | | 「日中予防外交研究会」第2回合同会議（北京）開催 |
| 3月15日 | | 在カンボジア代表事務所開設 |
| 4月 9日 | | 源馬謙太郎事務局員カンボジアへ（現在日本政府小型武器プロジェクト調査員） |
| 7月 9日 | | 明石会長、カンボジアに出張し、カンボジア政府・EUと共催で小型武器破壊式典挙行 |
| 13日 | | スリランカでサルボダヤ運動と共催で仏教僧侶会議開催 |
| 20-27日 | | 第1回e-Symposium on Conflict Prevention「紛争予防に関する最近の経験」開催 |
| 8月 1日 | | 久保拓人事務局員、国連コソボ暫定統治機構スケンデライ市暫定市長補佐として出向 |
| 9月3-7日 | | 紛争予防市民大学院『公開講座コース』開講（現在に至る） |
| 10月4-7日 | | スリランカでセワランカ財団等と共催で宗教間平和会議開催 |
| 9日 | | アフガニスタン難民救援のため、安藤宣孝在南西アジア代表事務所員をパキスタンに急派 |
| 25日 | | 「特定非営利活動法人日本紛争予防センター」設立発起人会開催 |
| 12月11-13日 | | アフガン復興NGO東京会議の紛争予防分科会を主催し、伊藤理事長が議長 |
| 2002年2月4-5日 | | 「日中予防外交研究会」第3回合同会議（東京）開催 |
| 6-14日 | | 第2回e-Symposium on Conflict Prevention「ポスト9月11日における紛争予防」開催 |
| 11-18日 | | 明石会長、阿曽村所長、アフガニスタンに出張し、Hamid Karzai暫定行政機構議長等と会見 |
| 28日 | | 東京都より「特定非営利活動法人日本紛争予防センター」として認証 |
| 4月 1日 | | 在アフガニスタン代表事務所開設
職業訓練プロジェクト開始（-9月30日終了） |
4月23日 | | カンボジアでCIDHと共同で小型武器回収・開発事業開始 |
4月30日 | | アフガニスタンでCPAUと共催で平和構築ワークショップ開催（-5月 5日まで） |
8月19日 | | 久保事務局員、国連アフガニスタン地雷対策センター(UNMACA)広報官として出向 |
9月17日 | | 小泉尊聖事務局参与、UNMACAへプログラムオフィサーとして出向 |
10月 3日 | | スリランカの国内避難民に職業訓練等を行うプッタラム・コミュニティセンター完成 |
4-14日 | | 「緊急在外活動要員候補者登録制度」より伊藤美保子をパキスタンへ派遣(第1号) |
25日 | | 明石会長、スリランカ問題担当の日本政府代表に就任 |
11月27日 | | 伊藤理事長、現地事業視察のためカンボジア、アフガニスタンへ出張（-12月6日帰国） |
12月9-16日 | | 阿曽村所長、地雷プロジェクト調査のためスリランカへ出張 |
2003年2月22日 | | 伊勢崎賢治理事、在アフガニスタンDDR日本政府特別顧問に就任 |
4月17日 | | デンマーク地雷除去NGO、DDGと提携覚書調印 |
5月22-30日 | | 第3回ｅ－Symposium on Conflict Prevention「テロリストか自由の戦士か？パレスチナ、チェチェン、その他紛争地域における平和の実現」開催 |
5月26-30日 | | 阿曽村所長、DDGと交渉のためコペンハーゲンへ出張 |
